Najprej moramo razjasniti namen uporabe mikro črpalke. O tem bomo razpravljali v treh glavnih kategorijah:
1. Če se mikro črpalka uporablja samo za izpust stisnjenega zraka.
Preprosto povedano, uporablja se samo za črpanje in polnjenje zraka, sesalna odprtina črpalke pa se redko uporablja. Ta primer je razmeroma preprost. Naslednje modele je mogoče izbrati po padajočem vrstnem redu izhodnega tlaka: PCF5015N, FAA8006, FAA6003, FAA4002, FM2002, FM1001. Seveda je treba upoštevati tudi pretok in druge pomembne tehnične parametre.
2. Če veljajo naslednje situacije, je treba izbrati izdelke serije PHW600B ali WAA:
Uporaba mikro črpalke za odvajanje zraka ali ustvarjanje vakuuma, včasih pa lahko v komoro črpalke vstopi tekoča voda.
Mikro črpalka mora biti sposobna črpati zrak in vodo.
Mikro črpalka se uporablja predvsem za črpanje vode, vendar je nezaželeno ročno dodajanje "polnilne vode" pred črpanjem. (Nekatere vodne črpalke zahtevajo ročno polnjenje pred delovanjem, da črpajo vodo iz nižjih nivojev; v nasprotnem primeru črpalka morda ne uspe črpati vode ali se celo poškoduje.) Prednost serije PHW600B ali WAA je, da ustvari vakuum, ko ni vode, z uporabo zračnega tlaka, da potisne vodo navzgor in nato začne črpati.
Pri uporabi miniaturne črpalke včasih morda ni vode za črpanje, kar povzroči stanje "suhega teka". Nekatere tradicionalne vodne črpalke so dovzetne za poškodbe zaradi "suhega teka", celo do te mere, da so smrtonosne. Vendar je serija PHW600B ali WAA v bistvu več-funkcionalna črpalka, ki združuje funkcije vakuumske črpalke in vodne črpalke; nekateri jo imenujejo "vakuumska vodna črpalka". Zato ustvarja vakuum, ko ni vode in črpa vodo, ko je. Vakuumsko in vodno črpanje sta znotraj običajnega delovnega območja in ni nevarnosti poškodb zaradi "suhega teka".